تتألف جزر القمر العربية من ثلاث جزر أساسية فضلا عن عدد آخر من الجزر الصغيرة. جميع هذه الجزر بركانية بينها بركان كومورو الكبرى الناشط والواقع على جبل ارتفاعه 2361م.
ليس في الجزر محميات بعد رغم وجود مناطق غير مأهولة تتمتع بحماية طبيعية شعبية، إذ يتوقف العمران على حدودها وأبوابها. وتستعد الحكومة حالياً لإنشاء أربع محميات بينها محمية بحرية في "موحلي" على جزيرة نيوماشوا (مساحتها 5 هكتارات) تكون مغلقة بوجه الصيادين والعامة ومفتوحة لعلماء الطبيعة وحدهم لإجراء دراسات واختبارات. وتجري دراسات أيضاً لإنشاء محميات مماثلة في جزيرة كومورو الكبرى، كما اقتُرح تحويل بركان كارثالا في الجزيرة نفسها إلى محمية وكذلك إقامة محمية برية للسلاحف.